(一)海洋漁業生產自動化

漁船主機監控自動化之研究

遠洋漁船自動導航航行裝置之引進

雙船式雷達操船模擬裝置之引進

遠洋鮪釣船自動掛枝繩設備之引進

美式近海鮪延繩釣作業自動化系統之引進與評估

鮪延繩釣漁穫物凍結自動化之研發

鮪漁之最適均溫凍結條件

遠洋魷釣船自動魷釣機之引進與改良

漁船廢棄物處理自動化之研發

定置漁業網口監視及自動遮斷裝置之研發

定置漁業自動化作業船油壓系統及船型之研發

全天候線上漁海況資料自動接收及傳送系統之建立　

(二)養殖漁業生產自動化

室內循環水養殖系統之研發

室內循環水養殖系統中生物濾床之研究

室內超高密度循環水養殖技術的研發

餌料生物生產系統自動化研發

傳統養殖水質自動監控系統之研發

多點氣送式及智慧型自動投餌系統之研發

文蛤採收裝置之研發

文蛤分級系統之研發

文蛤收穫後處理裝置之研發

自動化處理對文蛤風味影響之研究

養殖池水陸兩用動力船之研發

鰻魚分級機之研發

魚體尺寸重量自動量測器之研發